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电泳法鉴定燕窝真假是通过燕窝中聚丙烯酰胺凝胶电泳来区别鉴定燕窝的方法。该方法分别检验了燕碎、燕盏、天然燕窝加工品、官燕饼、草燕、原色龙牙官燕球王、龙牙官燕球王、白燕条等燕窝产品和明胶、银耳和猪皮等伪品。
结果燕碎、燕盏、官燕饼与天然燕窝加工品有与燕窝特征相符的谱带；其余加工品的谱带均与燕窝的特征带不同;草燕、白燕条及原色龙牙官燕球王没有燕窝的特征带，可能是掺伪太多，也可能是燕窝成分极微量或加工方法不当造成蛋白质的大量流失或酶解、水解成氨基酸，以至难以检出。
采用解离系统聚丙烯酰胺凝胶电泳法对燕窝及其伪品的可溶性蛋白进行电泳比较，结果正品燕窝中白燕与毛燕均有7条谱带，且谱带位置相同。血燕有8条谱带；散燕只有一条宽的扩散；其他加工品及常见掺伪品均无谱带。
对从印尼燕窝、怀集燕窝及常作为伪品的明胶，银耳、猪皮中提取的蛋白质，进行SDS APGE和等电聚焦电泳。发现印尼燕窝与怀集燕窝在SIDS APGE图谐上可见明显差异。
而明胶、银耳和猪皮等伪品可见特征性蛋白条带；燕窝蛋白经等电聚焦电泳可见清晰的蛋白条带，且主要集中于酸性端。
电泳方法用于鉴别不同品种燕窝及掺伪燕窝准确有效。
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